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Epidemiological dynamics of ESBL-producing Escherichia coli and strategies to optimise the management of community-acquired urinary tract infections

Adrien Biguenet

theses.fr (ABES), 2024

Abstract

Escherichia coli, principale bactérie responsable d'infections humaines dans les secteurs communautaire et hospitalier, constitue un défi majeur en raison de sa résistance croissante, notamment via les bêta-lactamases à spectre étendu(BLSE). Dans ce travail, nous avons analysé la dissémination des souches résistantes chez l'Homme, les animaux de compagnie et dans les eaux de surface. Nos résultats montrent que la population d’E. coli BLSE chez l’Homme est largement dominée par le clone ST131 et le gène blaCTX-M-15, et que cette population diffère de celle observée chez les animaux de compagnie. L’analyse des pratiques de prescription d’antibiotiques pour les infections urinaires a montré une adhésion inégale des médecins généralistes aux recommandations. L’utilisation d’antibiogrammes ciblés pourrait améliorer la conformité des prescriptions, bien que les durées optimales de traitement restent mal connues des médecins. Parallèlement, l’optimisation des outils diagnostiques, tels que la cytométrie en flux, pourrait contribuer à une meilleure gestion des prescriptions. La réévaluation des seuils de leucocyturie chez les personnes âgées permettrait d'améliorer la précision du diagnostic des infections urinaires, réduisant ainsi l'usage excessif d'antibiotiques. Nos résultats soulignent la nécessité d'intensifier les efforts pour minimiser les prescriptions non justifiées, dans le cadre d'une stratégie globale visant à combattre l'antibiorésistance.

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