Caracterización in silico y análisis filogenético de la malato sintasa de Paracoccidioides brasiliensis asociada a su proceso de infección
Abstract
Objetivo: Realizar la caracterizacion in silico de la proteina malato sintasa de Paracoccidioides brasiliensis relacionada con su proceso de infeccion. Materiales y metodos: Se obtuvo la secuencia aminoacidica de malato sintasa de P. brasiliensis (codigo de accesion: AQ75800.3) del GenBank. Dicha secuencia fue utilizada para determinar sus principales parametros bioquimicos, dominios y regiones conservadas, prediccion de estructuras secundarias y modelamiento tridimensional, empleando las herramientas bioinformaticas ProtParam, Clustal Omega, PHD Secondary Structure Prediction, SWISSMODEL, Phyre2 y Robetta, respectivamente. La visualizacion y comparacion de los modelos tridimensionales se realizo empleando PyMol. Finalmente, se busco el modelo de sustitucion aminoacidica con modelgenerator_v_85 y se uso para generar una filogenia de maxima verosimilitud en PHYML, la cual se visualizo en FigTree.
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