Caracterización in silico de la proteína Leishmanolisina (GP63) de Leishmania braziliensis y búsqueda de epitopes de utilidad para el desarrollo de vacunas
Abstract
Objetivo: Realizar la caracterizacion in silico de la Leishmanolisina GP63 de Leishmania braziliensis y busqueda de epitopes de utilidad para el desarrollo de vacunas. Material y metodos: Se obtuvo la secuencia aminoacidica de la Leishmanolisina de L. braziliensis cepa MHOM/BR/75/M2904 (codigo de accesion CAM37262.1) a partir de la base de datos del GenBank. Dicha secuencia fue utilizada para determinar sus principales parametros bioquimicos, dominios conservados entre proteinas cercanamente relacionadas, prediccion de estructuras secundarias y modelamiento tridimensional, empleando las herramientas bioinformaticas ProtParam, Clustal Omega, PHD Secondary Structure Prediction, SWISSMODEL, Phyre2 y Robetta, respectivamente. La visualizacion de modelos tridimensionales se realizo empleando PyMol y la comparacion de estos mismos. Resultados: La Leishmanolisina GP63 de L. braziliensis es una proteina de 66.8 kDa con un pI de 5.68. Asimismo, presenta un 34.2% de laminas β, seguido por un 20.7% de α helices y un 45.1% de loops internos, asi como un dominio conservado en el sitio activo (HEEXXH) caracteristico de la metaloproteasas dependientes de zinc. Finalmente, se encontraron tres clusters de peptidos correspondientes a epitopes potencialmente inmunogenicos distribuidos en la estructura tridimensional de la proteina. Conclusion: La Leishmanolisina GP63 de L. braziliensis es una metaloproteasa acida de alto peso molecular cuyo motivo de union al zinc contribuiria a su rol en la…
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